W oświadczeniu opublikowanym w lipcowym numerze "Więzi" ks. Michał Czajkowski przyznał się do trwającej 24 lata (1960-1984) współpracy ze Służbą Bezpieczeństwa. Wina moja jest bezsporna. Trudno 24-letnie uwikłanie tłumaczyć tylko epoką, naiwnością lękiem, zbytnią swobodą wypowiedzi - napisał w swoim oświadczeniu ks. Czajkowski.

Ks. Michał Czajkowski został oskarżony o współpracę z SB w maju na łamach
"Życia Warszawy" w artykule dr.
Tadeusza Witkowskiego, który na podstawie materiałów IPN napisał, że ks. Czajkowski był tajnym współpracownikiem o pseudonimie Jankowski.

Ks. Czajkowski współprzewodniczy polskiej Radzie Chrześcijan i Żydów i do momentu pojawienia się pod jego adresem zarzutów o współpracę ze specsłużbami PRL, pełnił funkcję asystenta kościelnego katolickiego miesięcznika "Więź".

Po analizie materiałów IPN dotyczących ks. Czajkowskiego, powołany przez redakcję "Więzi" czteroosobowy zespół opisał 24-letni okres współpracy ks. Czajkowskiego z SB. W jego składzie znalazł się historyk prof. Andrzej Friszke, redaktor naczelny "Więzi", Zbigniew Nosowski, Anna Karoń-Ostrowska i Tomasz Wisicki.